Le nombre de Français immatriculés en Estonie s'élève à environ 400.
Les liens entre la France et l'Estonie sont étroits, caractérisés par un échange politique fréquent. Un accord sur un partenariat stratégique entre la France et l'Estonie a été établi le 28 octobre 2020, signé par le Président français et le Premier ministre estonien. Cet accord a été enrichi d'un plan d'action pour 2021-2025, définissant les directions de croissance de cette coopération, et ratifié par les Ministres des Affaires étrangères des deux pays le 9 juin 2021. La France participe activement au Centre d’excellence pour la cyberdéfense basé à Tallinn depuis 2014, y déléguant notamment deux membres de son personnel.
Il existe un Lycée français en Estonie, le Lycée français de Tallin. Il est située dans l'arrondissement de Kesklinn à Tallinn en Estonie et les résultats de ses élèves aux tests nationaux estoniens sont parmi les meilleurs.
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